Първичната структура на РНК за ribonukleozidmonofosfatov редуване във веригата на полинуклеотид. В РНК, като ДНК, нуклеотиди, свързани 3 ', 5'-фосфодиестерни връзки. Краищата на веригите на РНК полинуклеотидни варират. В единия край е ОН група фосфорилирани 5'-въглероден атом в другия край - ОН група на 3'-въглеродния атом на рибоза, т.нар завърши 5 'и 3' краищата на веригата на РНК.
Вторичната структура на РНК
молекула рибонуклеинова киселина, изграден от същата полинуклеотидна верига. Отделни порции от РНК вериги образуват бримки spiralized - "остър", дължащи се на водородни връзки между допълнителни азотни основи A-U и G-C. Части от нишка РНК в тези спирални структури са антипаралелни, но не винаги напълно допълващи се, те са установили несдвоени нуклеотидни остатъци или едноверижни бримки, които не отговарят на двойна спирала. Областите в присъствие spiralized характерни за всички видове РНК.
Третичната структура на РНК
Единична верижна РНК се характеризира с компактен, подреден третична структура, произтичащи от взаимодействие spiralized вторична структура елементи. По този начин, образуването на допълнителни водородни връзки между нуклеотидни остатъци достатъчно отдалечени една от друга, или връзки между ОН групи на остатъци рибоза и основи. Третичната структура на РНК се стабилизира чрез двувалентни метални йони, например йони Mg2 +, свързването не само с фосфатни групи, но също така и с бази.
Основните видове РНК
Цитоплазмата на клетки съдържа 3 вида РНК - транспортна РНК (тРНК), месинджър РНК (тРНК) и рибозомна РНК (иРНК). Те се различават в първичната структура, молекулно тегло, конформация, дълголетие и най-важното, за функционална активност.
Методи за определяне на първичната и вторичната структура на нуклеинови киселини
Sekvenirovanie- е общото наименование на методи, които позволяват да се определи последователността на нуклеотиди в ДНК молекула. Понастоящем не съществуват метод секвениране, че ще работи за цялата молекула на ДНК; те са разположени както следва: първо получаване на голям брой малки участъци от ДНК (клонирана ДНК молекула многократно и "отрязани" то в произволни места), и след това се чете всяка секция поотделно.
Всички тези ефекти се получават предимно чрез промени в температурата на смес от ДНК праймери и полимерази; За нашите цели е важно, че това е доста точна процес и грешки в нея са редки, а изходът е на голям брой копия на части от една и съща ДНК. Различни методи за секвениране се различават един от друг не чрез клониране, но как след това се чете получената "супа" на множество копия на същата ДНК.
метод ДНК-ДНК gibridizatsiiosnovan на факта, че стабилността на ДНК-ДНК дуплекс при дадена температура зависи от броя на нуклеотиди, които са комплементарни двойки. Очевидно е, че броят на допълнителни нуклеотиди в дуплекса където двете вериги са получени от същата ДНК молекула (т.е., в homoduplexes) е равно на 100%. Ако двете нишки имат различен произход (хетеродуплексни), а след това, в зависимост от настъпили броя на мутации, броят на допълнителни двойки ще бъде по-малко от 100%. Съответно хетеродуплекси трябва да се разпадат (стопилки) при по-ниска температура, отколкото homoduplexes. Освен това, по-ниска температура на топене, по-голяма разликите в две последователности. Температура стабилност на хибридни ДНК определя от температурата, при която 50% от хибридна ДНК дисоциират в едноверижна форма. След това температурата се сравнява със средна температура от 50% homoduplexes топене двата вида последователности, участващи в образуването на хетеродуплекс, тази температура обикновено се обозначават Тт. Разликата между средната точка на топене и хетеросексуалните homoduplexes означен DTM. DTM показва линейна зависимост от броя на несдвоени бази (Britten сътр .. 1974): P = cdTm. Константата С обикновено се определя от условията на експеримента и обикновено варира от 0,01 до 0,015. Определяне DTM изисква голям брой повторения, като страхотно експерименталната грешка.
Основното свойство на ДНК е способността му да се репликира.
1.9. ДНК репликация, транскрипция, транслация, обратна транскрипция. Амплификация на ДНК. Протеин биосинтеза, аминокиселинен код. Провеждане на гени, структурата на гени в прокариотни и еукариотни, концепцията на клониране.
Replikatsiya- е процес на самостоятелно удвояване на ДНК молекули, получени ензими под контрол. Репликация се извършва преди всяко разделяне ядро. Тя започва с факта, че се развива ДНК спирала е временно под действието на ензим, ДНК полимераза. Всяка от вериги са формирани след разрушаване водородни връзки, въз основа на комплементарността синтезира дъщеря верига на ДНК. Снимки са достъпни за синтеза на нуклеотиди, които са в ядрото.
Схема ДНК репликация
По този начин, всяка полинуклеотидна верига служи като шаблон за нов комплементарна верига (и следователно процеса на удвояване на ДНК молекули се отнася до реакции на синтез матрица). Резултатът е две ДНК молекули, всяка от които една нишка е родителската молекула от (половин), а другата - на новосинтезирани. Освен това, една нова верига синтезира твърд, а вторият - първо под формата на къси фрагменти, които след това са зашити в дълга верига специфичен ензим - ДНК лигаза. В резултат на репликация, две нови ДНК молекули са точно копие на оригиналната молекула.
Replikatsiizaklyuchaetsya биологичен смисъл на точното предаване на наследствената информация от родителски клетки на дъщеря, която е това, което се случва, когато разделението на соматични клетки.
1) Н. Greene, William Stout, D. Taylor - биология.
2) ZA Shabarova и АА Богданов - химия на нуклеиновите киселини и техните полимери.
3) АР Pekhov - биология и General ginetika.
4) А. Mickelson - Химия на нуклеозиди и нуклеотиди.
5) H. Hauptmann, J. Graefe, Н. Remane - Органична химия
Transkriptsiya- този процес sintezaRNKs ispolzovaniemDNKv като шаблон с произход от всички живи клетки. С други думи, това е прехвърляне на генетична информация от ДНК РНК.
TranskriptsiyakataliziruetsyafermentomDNK-зависима РНК полимераза. Метод за синтез на РНК се извършва в посока от 5 'към 3' края, т.е. DNKRNK-polimerazadvizhetsya на нишката шаблон в посока на 3'-5 '.
започване транскрипция включва стъпки, удължаване и прекратяване. Транскрипция единица е транскрипцията, ДНК фрагмент, състоящ се от промотора, транскрибираната част и терминатор.
Започване transkriptsii- е сложен процес, който зависи от ДНК последователността в близост до транскрибира последователност (а ueukariottakzhe и от по-отдалечени райони на -enhanserovisaylenserov геном) и присъствието или отсъствието razlichnyhbelkovyh фактори.
В момента на преход от РНК полимераза транскрипционно иницииране на удължение е несигурна. Три основни биохимични събития, които характеризират прехода в случая на RNA polimerazykishechnoy Е.коли: отделяне сигма фактор pervayatranslokatsiyamolekulyfermentavdol матрица и силна стабилизиране на транскрипция комплекс, който в допълнение към полимеразата на РНК включва РНК нарастващата верига и транскрибира ДНК. Тези явления са типични за еукариотни РНК полимерази. Преходът от започване на удължение е придружено от прекъсване на връзки между ензим, промотор, транскрипция иницииращи фактори, и в някои случаи - прехвърляне на РНК полимераза в състояние на компетентност по отношение на удължаване. Удължение фаза завършва след освобождаване на нарастващия транскрипт idissotsiatsiifermenta от матрицата (прекратяване).
В стъпка vDNKraspleteno удължаване с около 18 parnukleotidov. Приблизително 12 нуклеотиди на спирала на ДНК шаблон верига образува хибрид с нарастващото края на веригата на РНК. Както движение РНК полимераза на матрица пред него има развиване и зад - редукция на двойната спирала на ДНК. Едновременно с друга връзка се освобождава РНК от комплекса на нарастващата верига на шаблон и РНК полимераза. Тези движения трябва да бъдат придружени от относителното въртене на РНК полимераза и ДНК.
Свързани статии