Molecular генетични маркери, характерни за някои типове молекулярни генетични маркери
Molecular генетични маркери
Молекулно генетичен маркер - сложна система, представена от два фактора. Първият от тях - уникален нуклеотидна последователност, което прави възможно да точно карта желания хромозомата. Вторият фактор - наличието в близост до предварително определена част от хромозома елемент или интра (или интер) на полиморфизъм на.
Генетичен полиморфизъм - промяна в нуклеотидната последователност на ДНК маркер, причинена от различните видове мутации (точкови мутации, инсерции, делеции и или други реконструкция хромозома). Форми на изразяване на генетичен полиморфизъм се наричат алели. Полиморфната естеството на конкретния локус увеличава с броя на алели. Наличието на две или повече алели е предпоставка за използването на локус като възможен генетичен маркер.
Един от най-важните условия за използването на молекулярни генетични маркери в разплод говеда с желаните характеристики и свойства е познаването на генетична особеност основа. Необходимо е в тези случаи, когато ние сме заинтересовани в знак не се определя от един единствен ген, ген група. В същото време, ако тези гени не са тясно генетична връзка един с друг, като се използва един от тях като молекулен генетичен маркер става много трудно. Въпреки това, е известно, че такива количествени гени често са свързани в така наречената "количествен черта локуси» (QTL) и са наследени заедно, което прави възможно използването на молекулярни генетични маркери.
Характеристики на някои типове молекулярни генетични маркери
Единични нуклеотидни замествания или SNP (от английски единичен нуклеотиден полиморфизъм в). SNP точка нуклеотидни замествания (мутации), са най-често срещаният тип на полиморфни маркери и представляват замяна на един нуклеотид с друг. Честота - един на хиляда базови двойки, а общият им брой на кравите в генома достига три милиона (някои до десет милиона). Стойност и triallelnyh биалелни единична нуклеотидни замествания значително изместен към биалелен тъй Процент trialelnyh фракция е една десета процента. Ето защо, SNP маркери имат ниско ниво на полиморфизъм и висока еволюционна консерватизъм.
- синоним - не се проведе за подмяна на аминокиселинния състав на кодирания протеин
- nonsynonymous - променя състава на аминокиселината на кодираните протеини.
Единични нуклеотидни замествания могат да променят активността на промотора, оказват влияние върху конформацията на ДНК и предварително иРНК, определяне на нивото на генна транскрипция и ефективност на съединяване.
Тандемни повтори - е повторение на определени последователности в ориентацията на "глава на опашка". Тъй като в един локус повтаря същата мотив, последователностите са наречени сателити.
Тандемни повтори се превърнаха в един от най-високо информативни генетични маркери в селскостопански животни, тъй като броят на тандем повтаря в различни животни сателити варира.
Maksisatellity - обща дължина на повтарящи се последователности на повече от 5 т.к.
Minisatellites - обща дължина на фрагмента е от няколко хиляди до 30 хиляди т.к. Така мотиви дължина в диапазона 10-60 т.к. [Джефрис, 1985].
Микросателити - общата дължина на фрагмента обикновено по-малко от 350 бд, а дължината на мотива е обикновено от два до шест т.к. [Tautz, 1989]. Микросателити се транскрибират и не-транскрибирани ДНК сайтове.
От гледна точка на информация може да бъде разделена полиморфни маркери на биалелен (единичен нуклеотидни замествания) и multiallelnye (тандемни повторения и дисперсната система).
В нашето изследване се фокусира върху единични нуклеотидни замествания, тъй като той е сред тях са генетични маркери на дълголетието при говеда.