След четири дни на безплодно търсене на следващата дейност Geth неидентифициран кораб нападнат Нормандия и да го реже на парчета. Повечето от членовете на екипажа е напуснал кораба, но Жокера е пренебрегнала заповедта и остана в пилотската седалка, вярвайки, че колкото повече може да спаси кораба. Шепърд отиде да спаси Joker. Веднага след като той постави на пилота в капсула спасителна командирът бил хвърлен от експлозията. В резултат на това делото е бил повреден и хвърлен Шепърд в космоса. В крайна сметка, костюмът не може да устои на изолацията. Шепърд идва към своя край. Той е починал от задушаване, към което се добавя огън костюм, при влизане в атмосферата, към която започва да привлича герой.
Известен със своята информираност за всичко, което се случва в галактиката, Грей посредник, нает Feron, Drell подчинени на тялото извади Шепърд. В същото време, Liara T'Soni, който иска Шепърд след нападението на Цитаделата, Cerberus нает за същата цел като медиатора. Fearon щеше да тече една поръчка и да даде Грей Междинното командващия на тялото, докато не чух за сделката им Bossano с колектори. Поради това, той решава да помогне на Cerberus. Веднага след като Liara и Feron получите тялото на Шепърд, те решават да му се даде про-човешки организация, а не позволяват на изкупвача да го присвоят.
В резултат на Cerberus, наречена Проект Лазар Шепърд той е бил върнат към живот, показвайки комбинация от органични и синтетични. Две години по-късно, Шепърд се събужда в нападение срещу космическата станция Cerberus. Както можете да се придвижват в станцията Шепърд се учи на проекта Лазар, за извършената работа от неговия възраждане и средствата, инвестирани в него всички. Въпреки намерението да го направи същото, както преди, Шепърд осъзнава, че най-вероятно там нещо се промени завинаги. Известно време Ghost, лидер Cerberus, Шепърд се отнася до като назад или в преносен смисъл, все още спи.
Докато Командира не беше човешки колонии изчезват без следа. Заради бездействието и политическа бюрокрацията и на Съвета на Алианса, Cerberus остава единствената организация в състояние да се справи с опасността. Шепърд се съгласява да сътрудничи с Дух, за да узнаем истината. Слуховете, че Шепърд оцелели сея тревожност. Някой дори започнах да мисля, че Шепърд тайно търси причините за изчезването на колониите.
Поради факта, че Шепърд се събуди, за да завършите операцията да го възстанови, лицето му бе осеян с лъскави белези. Те могат да служат като един вид показател. Приходи Paragon прави белезите се свиват и изчезват, докато все точки Renegade разширява белезите, дава голи големи оранжеви кибернетични импланти. Високи темпове Renagata правят изродени очи. На първо място, те ще бъдат малко блясък в рамките на ириса. При достигане на последните две Renegade мащаб клетките очите започват да светят видимо червено.
Веднага след получаването на достъп до техническата лаборатория Нормандия, Шепърд получава писмо от лекар Chakwas който обяснява, че положителните мисли да изчезнат белезите. Също така, след като подобрение Медицински отделение, става възможно да се скрие кибернетичните хирургически импланти и да се ускори процеса на оздравяване. Ако играчът избере хирургия, белезите излекувани незабавно и да спрат действията Шепърд се отрази на външния вид. Това подобрение е на стойност 50,000 платинени парчета.
