Подобно на повечето имперски организация, Инквизицията е обширна и обхваща галактика безброй агенти. Но приликата свършва, защото вътрешната структура е различна от Inquisition чудовищен бюрокрация Адептус Terra. Целта на открито на своя мандат е проста: да се защити на императора и човечеството от всякакви заплахи чрез всички налични средства. Такава задача изисква абсолютна гъвкавост: спектър от заплахи, вариращи от един мутант за конспирации и чужди нашествия, протичащи в рамките на цялата система и сектора.
Основната оперативна единица на Инквизицията - инквизитор. Докато Imperium стене под тежестта на огромни организации и невероятната бюрокрация, Инквизицията е свободен от тези окови и на тази основа, е свободен да действа, тъй като изглежда, че е вярна. Наличието на ясна цел - да се бори заплахата за човечеството, Инквизицията работи, за други имперски организации, но има абсолютно влияние върху тях.
На практика Инквизицията трябва да бъде много по-гъвкава, отколкото позволява на своя мандат. Въпреки факта, че неговата сила идва от императора, а дори и Върховните лордове на Terra не може да бъде по-висок от неговия надзор, Инквизицията трябва да разчита на други компоненти на Империята, за да получите ресурси. Потенциално, Инквизицията има невероятна сила - тя има достъп до войски, въоръжение, архиви и информация по-голямата част от имперските организации, но това ще получите всичко това, тя е принудена да се обърне към Адептус Astartes, Имперската гвардия, Адептус Механикус или други структури.
Инквизицията не съществува като сила в себе си, но като ръководен ръка, която позволява на Империята по определен начин, за да се защитават сами. Повечето от работата му е посветена на търсенето на заплахи за човечеството и подготовка на Резкият отказ. В същото време с инквизиторите, Инквизицията има милиони, дори милиарди възможни средства на територията на Империята, гледане на появата на мутации, заплахата от външна агресия, предателство и опасните прояви на некомпетентност.
Всеки инквизитор олицетворява цялата Инквизицията и има цялата сила на организацията. Word инквизитор абсолютна и не може да се оспорва от никого, освен другите инквизитори. Инквизитор поема отговорност за действията, необходими за защита на Империята. Доказателство за смелостта и достоверността на инквизиторите е, че Инквизицията поддържа позицията си в продължение на десет хиляди години, въпреки войни, междуособни конфликти и вътрешен ерес. Мъжете и жените на Инквизицията един от най-доверените, обучени и мотивирани хора, и те трябва да бъдат.
Инквизитор се нуждае от нещо повече от физическа сила и оборудване, което надхвърля границите на конвенционалните оръжия. Неговата сила - съзнанието му, но не само като интелектуална сила, но също така и като сила на волята. В една галактика, управлявана от догми и консерватизъм, инквизитора трябва да остави настрана предразсъдъците и да работи извън традиционните основи.
Бъдете един инквизитор - средства, за да разберат силите, които работят срещу Империята, не може да разбере напълно един човек, дори и ако той принадлежи на тези, които седят в Senatorum Imperialis. Необходимостта да се бори с десет хиляди години натрупан мъдрост и установени православие - не е лесна задача, но Инквизицията е ефективен инструмент. Важно е, че инквизиторите могат да виждат света през очите, а не мътни доктрини или арогантност.
За да се избегне монотонни, бавни процеси, които са чумата на други имперски организации, Инквизицията се основава на един-единствен фундаментално ниво - един-единствен инквизитор. От тази оригинална концепция, инквизитора да използвате всички налични ресурси, които могат да бъдат необходими, за да се справи със заплахата - без да е необходимо да се консултирате с Адептус Terra.
Инквизитор с антуража си да се справят с множеството заплахи, без външна помощ. Култове и техните последователи, ренегат командири, малки групи от извънземни и други опасности пред които са изправени Инквизицията всеки ден, могат да бъдат отстранени бързо, чрез премахване на дадено лице, което е в основата на заплахата, или унищожаването на ядрото на враждебни фракции.
Често сложността на проблема може да надвишава капацитета на инквизитора и той ще трябва да се прибегне до помощта на местните сили, най-често това е най-Адептус Astartes или планетарни отбранителни сили. Инквизитор може да се наложи да превозва да пътуват през системата, или, по-вероятно, за да се увеличи огнева мощ, за да издържат разпръснати секти или мощни физически лица. В този случай, той може да продължи два начина: публично да обяви присъствието си и да се изгради сили, които се нуждае, или ако ерес проникнала дълбоко в местните организации, да се обръщат към агенти, както и от стоим на сянка, съобщете за проблема на императорския командир, или друг лоялен лидер. Забавяне в отговор на такава информация в такава ситуация е вероятно да вбесявам на инквизитор, и той ще трябва да прибегне до много по-строги методи.
В някои случаи местните сили не може да бъде достатъчно - поради липса на хора, или защото самите те са по някакъв начин могат да бъдат свързани с проблема. В такива случаи, инквизитора имат контакт с външни сили.
Подобна ситуация е много трудно за инквизитор, защото всички Империята е много бавно, и опасността може да достигне застрашителни размери, преди да пристигнат войски в състояние да се справят с него. Движението на големи групи от въоръжените сили, дори и за кратки разстояния отнема огромни интервали от време, като по този начин ще създаде затруднения инквизитор. По времето, когато войските най-накрая пристигат, тя може да се окаже, че проблемът вече е надраснала възможност за потискане на хората в зависимост от броя.
По този начин, на Инквизицията често трябва да действа като движеща сила. Ако планетата е била нападната от извънземни, корупция, хаос, или други сериозни заплахи, задължението инквизитор - да се направи машина работа война и наблюдение на неговото действие. Често, адмирали и полковници на Империята, пристигайки на сцената, дори не знаят какво Инквизицията водени поредица от събития, в резултат на което те са били на това място в този момент.
Една от основните области на Инквизицията, която често води до проблеми и борби, но в същото време се използва за решаване на много проблеми, е връзката с Space Marine глави. Както и инквизиция Space Marines работните повече извън Империята, а не като неразделна част. Поръчки се яростно защитни от независимостта си и е малко вероятно да бъде щастлива намеса в техните вътрешни работи.
Инквизиторът, който се съмнява, Ордена на ерес, трябва да бъдат много внимателни. Space Marines е исторически са били много по-независим от другите императорските войски, но опасността е, че всяка поръчка ще падне под влиянието на хаоса прави Инквизицията постоянно да следи всички тенденции в рамките на тези групи. Чистотата на мотивите и действията на гени са под постоянно наблюдение и парашутистите се смятат за такива проверки законосъобразно.
В православен, прави инквизитори често имат проблеми в комуникацията с Адептус Astartes просто защото те също работят извън догма и бюрокрацията на Империята. Какво може да изглежда като ерес, и самочувствие, от една страна, тъй като може да се разглежда като необходим компонент на ефективността на Space Marines. Възможността да се действа по свое усмотрение, да се включат, когато е необходимо, и да действа като изглежда е необходимо, е много важен инструмент в тяхната мисия да защитават човечеството. Често отклонение от традицията е лесно да се бърка с нелоялност, и имаше няколко случая, при запалени инквизитори видяха проблем, когато има такива. Space Marines са праведни, те се гордеят с тяхната лоялност към императора, а в същото време да остане извън политиката. Те ще са отговорни само пред своя Учител на Ордена и самият император, и заръчаното за нелоялност към тях - един чудовищен обида. Използването на сила срещу имперските Marines - е унищожаването на връзките, които съществуват между поръчките и Империята.
Поради това, на разумна инквизитор няма да бързат. В случаите, когато на Ордена се превръща в заплаха, най-логичното решение - да се използват друг за да се елиминира опасността. Space Marines - първокласен мощност, с която конвенционалните сили не могат да се справят, както и способността да използват собствения си, че те се справиха с друг - безценно. Морски пехотинци имат силни връзки помежду си, а ако Господаря на Ордена установи, че колегите му се поддали на изкушението да Хаос, той ще реагира бързо, за да защити честта на Адептус Astartes като цяло, тъй като Ордена на отстъпника - петно върху репутацията на всички Space Marines, което е необходимо незабавно, "отмие ".
Често, Space Marine глави достатъчни, за да се изправят заедно с братята си, а не агент на Империята, което ще видите собствените си грешки и да променят поведението си. Ако критиката не идва от "своите", отговорът на това може да бъде много, много трудно, е възможно да се превърне в още по-голяма заплаха за развитието в рамките на Ордена. Не е често ситуацията дума за такова състояние, че единственият изход - унищожаването на Ордена. Това е много трудно решение, често това са участвали множество други поръчки или по тяхната собствена воля или по искане, като, например, това се е случило по време на въстанието, което доведе до Badabskoy война.
Очевидно е, че най-добре е, ако Инквизицията се справиха със заплахи за техните собствени, като се избягват опасните взаимодействия и използването на чужди въоръжени групи. Поради тази причина, Инквизицията съдържа свои собствени въоръжени сили, като DeathWatch екипа и ловни демони Сивите рицари.